Institut klinické a experimentální medicíny nakládal s majetkem a veřejnými penězi v rozporu se zákony i vlastními předpisy. Kontroloři Nejvyššího kontrolního úřadu prověřili 102 případů za 905,3 milionu korun z let 2022 až 2024 a pochybení našli u téměř 47 procent vzorku. Ve třiceti kontrolovaných veřejných zakázkách v rozporu se zákonem zadal plnění za 380 milionů korun.
Institut podle kontrolorů zadával zakázky jedinému dodavateli bez soutěže, dělil plnění na samostatné objednávky a přijímal nabídkové ceny, aniž by ověřoval, zda odpovídají místu a času. U vývoje aplikací a kybernetické bezpečnosti tak bez soutěže vyplatil třem dodavatelům 59,5 milionu.
Pronájem a servis operačního prádla si IKEM objednával u dosavadní firmy ještě rok a půl po skončení smlouvy a zaplatil za něj 3,6 milionu korun. V následné soutěži pak požadoval přesné materiálové složení prádla odpovídající parametrům téhož dodavatele, ačkoliv sám používal i prádlo s jiným složením. Tím podle úřadu bezdůvodně zúžil okruh uchazečů.
Za experimentální magnetickou rezonanci institut akceptoval jedinou nabídku a zaplatil 72 milionů korun bez daně, veřejně dostupné zdroje k porovnání ceny nepoužil. Smlouvu na ubytování zaměstnanců uzavřel už v roce 2005 na dvacet let bez zadávacího řízení a mezi roky 2015 a 2025 za tyto služby poslal dodavateli přes 104 miliony korun.
Nedostatky provázely i vyřazování majetku, u 77 procent zlikvidovaných položek chyběly doklady o tom, co bylo skutečně vyřazeno a jak s tím institut naložil. Sedmnáct případů možného porušení rozpočtové kázně za 182 milionů už putovalo na finanční úřad, který může vyměřit odvod zpět do státního rozpočtu.
IKEM je státní příspěvkovou organizací Ministerstva zdravotnictví, které vede Adam Vojtěch. V roce 2024 hospodařil s aktivy za 11,4 miliardy korun a náklady na hlavní činnost mu dosáhly 6,2 miliardy. Vnitřní kontrolní systém institutu podle úřadu opakovaně selhával a bez jeho změny hrozí, že se stejná pochybení budou opakovat.
